본 발명은 암 줄기세포에 특이적으로 결합하는 압타머에 관한 것이다. 본 발명에 따른 압타머는 암 줄기세포에 특이적으로 결합하고, 암 줄기세포의 특성인 세포 부착능, 세포 증식, 항암제 내성 및 세포 이동을 감소시킴으로써 우수한 항암 효과를 가지고 있는바, 암의 진단, 예후 예측 및 치료 분야에서 다양하게 활용할 수 있다.