본 발명은 라이코펜을 생산하는 재조합 미생물 및 이를 이용한 라이코펜의 생산방법에 관한 것으로서, 보다 구체적으로 gapA 발현량 조절을 통해 라이코펜의 생산성을 향상시킨 라이코펜 생산용 재조합 미생물 및 이를 이용한 라이코펜의 생산방법에 관한 것이다. 본 발명에 따른 gapA 발현량을 감소시킨 재조합 미생물은 라이코펜 생산을위한 G3P pool을 직접적으로 증가시킴에 따라 라이코펜의 생산성이 모균주에 비해 현저하게 증가하는바, 라이코펜이 활용되는 다양한 산업분야에서 광범위하게 적용할 수 있다.