본 발명은 나린제닌(Naringenin) 고생산균 스크리닝을 위한 리보스위치 및 나린제닌 고생산균 균주의 스크리닝 방법에 관한 것이다. 본 발명의 나린제닌 압타머, 10개의 염기로 이루어진 링커 서열, 및 선택 표지 유전자를 포함하는, 나린제닌(Naringenin) 고생산균 스크리닝을 위한 리보스위치 및 나린제닌 고생산균 균주의 스크리닝 방법을 이용하면 나린제린에 특이적인 압타머에 의해서 나린제닌을 특이적이고 민감하게 인지할 수 있으므로, 나린제린을 고농도로 생산하는 균주를 빠르고 쉽게 선별할 수 있으며, 이를 이용하여 미생물을 이용한 나린제닌 생산의 가격 경쟁력을 높일 수 있다.