본 발명은 각막이상증 진단용 바이오센서 및 이의 용도에 관한 것이다. 본 발명에 따른 바이오센서는 BIGH3 유전자의 점 돌연변이를 타겟으로 하는 토홀드-매개 DNA 치환 반응 및 표면증강 라만산란 활성을 이용하는 것으로, 라만 시그널의 민감도 및 안정성이 우수하고, 상기 바이오센서를 이용하여 BIGH3 유전자의 점 돌연변이를 검출하는 경우, 단순하고 경제적인 방법으로 우수한 각막 이상증 진단 효과를 나타낸다.