본 발명은 TMEM39A(Transmembrane Protein 39A) 유전자 및 이의 용도에 관한 것이다. 본 발명에 따르면, 암, 특히 뇌종양을 진단할 수 있는 마커로서 TMEM39A에 대한 검출 제제를 제공함으로써, 해당 환자에게서 상기 유전자 또는 그 단백질의 발현 수준을 측정 및 비교하여 발병 진단, 질병 정도 예측 또는 파악할 수 있으므로, 암, 특히, 뇌종양의 치료 및 예후 관리에 유용하게 사용될 수 있다.